Les certificats et attestations délivrés au terme des formations relevant de l'application de l'article 49 sont identiques à ceux de l'enseignement secondaire de plein exercice, avec pour précision qu'ils ont été délivrés dans l'enseignement secondaire en alternance.
La réussite d'une année d'études de l'enseignement secondaire "article 49" est sanctionnée comme dans l'enseignement secondaire de plein exercice. Une attestation d'orientation A, B ou C est donc délivrée à tout élève au terme de chaque année.
Le CESS peut être obtenu au terme d'une 6ème année en technique de qualification en alternance ou 7ème année professionnelle complémentaire ou de qualification en alternance.